杨剑课题组
各实验室介绍
课题组介绍
杨剑课题组是目前中国医学科学院病原生物学研究所唯一专门从事生物信息学相关研究的团队。课题组包括由研究员、副研究员、助理研究员和博士后等多人组成的核心科研团队，专业涉及医学、生物学、物理学、计算科学和生物医学工程等多学科背景，注重学科交叉融合特色发展。近年来，课题组兼顾病原生物学基础研究和传染病防控重点需求。一方面，课题组通过大数据整合与挖掘、设计通用分类方案、开发在线识别系统和卷积神经网络模型等，成功建立国际上最大的病原细菌毒力因子数据平台VFDB，并先后揭示了细胞外可伸缩注射系统和毒素复合体等多种毒力因子的遗传多样性和结核分枝杆菌的耐药性特征，通过生物信息学探索推动了相关病原菌的致病和耐药机制研究；另外一方面，课题组面向新发传染病防控重大需求，在国际上最早探索基于宏基因组的病原体高通量筛查数据挖掘新方法，并建立了全球首个重要疫源生物相关病毒数据平台ZOVER，参与近年来的多次重大疫情相关病原体鉴定和数据分析，为我国新发传染病疫情防控能力提升贡献了力量。课题组近五年培养博士研究生5名，均按期毕业，其中1人次获得国家奖学金、1人次入选北京市优秀毕业生、3人次入选北京协和医学院优秀毕业生。