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综合新闻

任仙文博士等在《Clinical Microbiology and Infection》杂志在线发表论文探讨二代测序技术在甲型流感病毒检测中的应用

发布日期:2015-02-26 字号:

甲型流感病毒对人类健康构成严重威胁。由于甲型流感病毒共有八个基因组片段,所以不同型别甲型流感的重配极大地提高了甲型流感病毒的多样性,这不仅对人类的免疫系统提出了挑战,同时也为检测和鉴定甲型流感病毒基因组各片段的型别带来了困难。目前临床上对甲型流感病毒的快速检测主要依赖PCR扩增技术,然而由于在理论上甲型流感病毒不同亚型片段重配方式可达上百种之多,实际检测中PCR检测技术不能全部覆盖。当新型甲型流感如H7N9型和H10N8型禽流感感染人导致严重疾病甚至导致在人际传播时,PCR检测技术不能全面提供病毒基因组各片段的鉴定信息,从而也难以进一步对其传播风险、毒力、耐药性等给出评价。随着高通量测序技术的不断发展,特别是台式(benchtop)测序仪的出现,为快速、通用、灵敏、准确地鉴定甲型流感并进行分型、各基因组片段的遗传特征和风险评估提供了技术基础。任仙文博士等在该项研究中基于真实的检测数据,给出了临床上应用Ion Torrent和Illumina MiSeq这两种新型台式测序仪检测和鉴定甲型流感病毒的评价,研究发现这两种测序仪不仅可以作为甲型流感的通用检测设备,也可以作为准确的分型设备,而且可以为病毒溯源和毒力评价、耐药评价等提供富有价值的参考信息,具有不可替代的临床应用价值。

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